からだは細長い葉と地下茎からなり，砂泥域に地下茎を伸ばして生育する雌雄同株の多年生の草本（種子植物）である。沿岸域の主要な一次生産者であり，多様な動物の生息場所となる「アマモ場」を形成する。葉は細長く，先端はわずかに尖り，５〜７本の葉脈（維管束）が葉の先端から基部まで平行に走っている。葉の縁には顕微鏡的な鋸歯は見られない。種子による繁殖と，地下茎から新芽を出す栄養繁殖を行う。花は６月頃に咲く。

和名「アマモ」は，地下茎を噛むと甘みを感じることに由来する。また，植物名としては日本一長い，「リュウグウノオトヒメノモトユイノキリハズシ」という別名を持つ。属名のZosteraは女性名詞で，細長い葉形の特徴を表すギリシャ語のzoster（帯，ベルト）に由来する。種小名「marina」は女性形で，「海中生の，海の」の意味。

銚子でみられる他の海産種子植物（海草）としては，スガモやエビアマモなどがある。それらは岩礁域に生育し，葉の縁に顕微鏡的な鋸歯が見られる点で，アマモとは区別する事ができる。

砂泥域にしばしば優占する海産種子植物のアマモやコアマモなどは，砂泥中に地下茎を伸ばして根をはって体を固着することができる。一方，多くの海藻は石や岩などの基質に付着器や仮根で固着することによって生育しているため，付着基質の乏しい砂泥域に生育する種類は比較的少ない。緑藻類の子孫である陸上植物が海中に戻ってきたあるいは戻って来ることができた背景には，上記のように海藻類があまり生育していない場所が存在した，つまりニッチ（生態的地位）が空いていたと考えられる。

葉の長さ：２０〜１００ｃｍ　幅：３〜５ｍｍ